A mata ciliar é uma área de preservação permanente - APP espaço legamente protegido por lei em função da sua contribuição com a retenção do solo e de sedimentos, contenção de erosão, e redução do assoreamento, além de contribuir com da manutenção da biodiversidade.
No entanto, ao longo dos tempos, nas margens do Rio São Francisco é comum a retirada indiscriminada da vegetação ribeirinha, queimadas, especulação imobiliária, implantação de grandes projetos agropecuários, aplicação de agroquímicos, lançamento de esgotos, lixo, e outras ações antrópicas que contrariam o conceito de APP. Dessa forma, foi realizado o levantamento florísticos em áreas remanescentes da mata ciliar com o intuito de indentificar as espécies vegetais e coletar sementes para a produção de mudas. Ações de recomposição da mata ciliar estão sendo realizadas na comunidades de Conchas no munícipio de Juazeiro a partir da criação de unidade demostrativas. Para tanto, foi realizado um diagnóstico sócio-ecomonico ambiental, sensibilização dos ribeirinhos quanto à importância da recompor a mata ciliar, e plantios e ou enriquecimento de áreas ciliares com espécies nativas.